Sekolah Transformasi Sosial yang diselenggarakan MITRA AKSI adalah suatu program pendidikan sistematik yang bertujuan untuk melahirkan kader-kader pendidik dan penggerak di tingkat desa. Mereka dibekali, antara lain, dengan kemampuan dasar pengorganisasian masyarakat, metodologi pendidikan kerakyatan, dan beberapa ketrampilan teknis pemetaan dan perencanaan pembangunan desa, budidaya pertanian, konservasi ekosistem, dan teknologi tepat guna.

Inti dari proses pendidikan ini adalah membentuk dan melahirkan para penggerak (aktivis) masyarakat sipil agar mampu menjadi pemimpin atau fasilitator gerakan sosial, terutama di tingkat basis akar rumput di kawasan perdesaan, untuk menghasilkan suatu strategi dan metodologi yang tepat membangun Indonesia yang dimulai dari desa. Salah satu prasyarat dasar untuk menumbuhkan kedaulatan masyarakat atas sumber-sumber kehidupan berkelanjutan adalah tersedianya kader-kader transformasi sosial yang handal, memiliki kecerdasan dalam membaca kecenderungan perubahan di tingkat mikro dan makro, serta mampu mengolahnya menjadi alat atau media penyadaran kritis di masyarakat. Karena itu, STS Mitra Aksi berupaya menciptakan kader-kader transformasi sosial yang handal, kreatif dan siap bekerja bersama masyarakat. Sekolah ini secara khusus mengembangkan kurikulum yang mampu menjawab isu-isu kritis dan nyata, terutama di tingkat basis tempatan.

Pusat Pendidikan dan Pelatihan Mitra Aksi beradad di atas lahan seluas 3,5 Ha yang sekaligus merupakan kompleks pusat kegiatan dan perkantoran Mitra Aksi. Selain ruang-ruang belajar dan diskusi, Pusat Pendidikan & Pelatihan Mitra Aksi juga dilengkapi dengan aula pertemuan berkapasitas 200 sampai 400 orang, ruang-ruang kerja, laboratorium, perpustakaan, pusat data dan media, dapur umum dan kantin, penginapan peserta, dan perumahan karyawan (staf). Semua ruangan yang ada di kompleks ini dilengkapi fasilitas pengatur suhu udara. Ruang-ruang kerja dan ruang pertemuan dilengkapi dengan sarana jaringan internet (wi-fi dan LAN). Selain itu, lebih dari separuh seluruh luas lahan di kompleks ini masih merupakan ruang-ruang terbuka, lapangan dan taman, kolam-kolam ikan, kebun contoh dan lahan praktik atau ujicoba.

Sampai saat ini, prasarana dan sarana laboratorium yang dimiliki oleh Mitra Aksi berupa ‘Laboratorium Petani’ yang masih memusatkan perhatian utamanya pada pengembangan agensi hayati (mikrobiologi) dan uji karbon pepohonan, selain melakukan riset  tanah, hama, ekosistem kawasan, dan pengembangan pupuk organik untuk kebutuhan petani. Laboratorium ini juga berfungsi sebagai rumah penyimpanan benih padi lokal dari berbagai daerah dan tipologi ekosistem. Laboratorium ini  dilengkapi dengan berbagai peralatan serta staf yang berpengelaman di bidangnya. Laboratoium utama berada di kompleks Pusat Pendidikan dan Pelatihan Mitra Aksi di Pijoan, Muaro Jambi, sementara beberapa pusat kegiatan kelompok tani dampingan di berbagai desa di Jambi merupakan ‘laboratorium lapangan’ sebagai tempat ujicoba, percontohan, dan penyebarluasan.

Demikian pula halnya dengan prasarana dan sarana perpustakaan.  Di kompleks Pusat Pendidikan dan Pelatihan Mitra Aksi di Pijoan, Muaro Jambi, terdapat ‘perpustakaan pusat’ yang dilengkapi dengan pusat data dan media. Sementara itu, pusat-pusat kegiatan (‘Pondok Belajar’) para petani dampingan di berbagai desa di seluruh Jambi adalah sekaligus merupakan ‘perpusatkaan lapangan’ yang dikelola oleh warga dan kelompok tani setempat. Sampai saat ini, jaringan ‘Pondok Belajar’ para warga dan petani yang diorganisir oleh Mitra Aksi telah menyelesaikan dan menerbitkan berbagai risalah (buku, panduan, media audio-visual) –terutama tentang masalah-masalah pertanian, pangan, energi, eksositem, konservasi, tata ruang, pengorganisasian masyarakat– berdasarkan hasil-hasil praktik dan pengalaman nyata para warga dan petani sendiri. Sebagai bagian dari jaringan nasional Indonesia Society for Social Transformation (INSIST), sebagian besar risalah tersebut diterbitkan bekerjasama dengan INSISTPress di Yogyakarta.

‘Rumah Pupuk’ adalah prasarana dan sarana uji coba bahan-bahan alami yang ada di sekitaran petani (yang mudah di dapatkan) untuk di ramu menjadi pupuk. Setelah melalui proses tertentu dan diketahui kandungan setiap bahan-bahan alami tersebut, barulah di terapkan di lokasi yang sesungguhnya, yakni lahan-lahan produksi atau budidaya para warga dan petani dampingan Mitra Aksi. Sampai saat ini, jaringan ‘Rumah Pupuk’ Mitra Aksi sudah menghasilkan berbagai jenis dan bentuk pupuk alami, selain beberapa jenis pembasmi hama pengerat (pestisida), serangga (insektisida), gulma (herbisida), dan jamuran (fungisida) organik. 

Biasanya, parasarana dan sarana ‘Rumah Pupuk’ jaringan Mitra Aksi berdiri berdampingan dengan ‘Rumah Benih’ –umumnya dalam bentuk bangunan ‘rumah kaca’ (greenhouse)– sebagai tempat pengembangan jenis-jenis benih atau bibit lokal, selain sebagai tempat karantina benih atau bibit sebelum ditanam oleh petani.